Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Phf11bB4XVQ1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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