Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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