Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssxb8B1AY40 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssxb8B1AY40 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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