Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms