Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms