Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms