Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms