Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tsc22d3Q9Z2S7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms