Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms