Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uso1Q9Z1Z0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms