Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cpne6Q9Z140 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms