Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh2d3cQ9QZS8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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