Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim44Q9QXA7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim44Q9QXA7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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