Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms