Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3b2Q9JME5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms