Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms