Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms