Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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