Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prg3Q9JL95 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms