Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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