Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms