Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms