Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan4Q9DCK3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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