Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Swt1Q9DBQ9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms