Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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