Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cyp2c55Q9D816 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms