Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc9bQ9D6E4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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