Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ptp4a3Q9D658 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ptp4a3Q9D658 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ptp4a3Q9D658 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ptp4a3Q9D658 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ptp4a3Q9D658 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ptp4a3Q9D658 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms