Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Zcchc13Q9D548 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms