Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc7Q9D541 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc7Q9D541 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7Q9D541 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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