Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Snapc3Q9D2C9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms