Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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