Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms