Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms