Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ddx28Q9CWT6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddx28Q9CWT6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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