Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MINDY3Q9CV28 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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