Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms