Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms