Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms