Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp2Q9CQ73 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms