Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms