Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms