Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprtQ99M80 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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