Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms