Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms