Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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