Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms