Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms