Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx18Q91ZR2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms