Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnajc28Q8VCE1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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